Vid utvärdering av livsmedelssäkerhet måste det primära fokus vara på att identifiera och förstå potentiella faror. Forskare över hela världen har kategoriserat dessa faror i tre huvudtyper: biologiska, fysiska och kemiska. Bland dessa anses biologiska faror vara de mest betydande, särskilt i bearbetade livsmedel. Men ansträngningar för att eliminera biologiska risker kan ibland leda till ökade fysiska och kemiska faror om de inte hanteras på rätt sätt. Till exempel tillsätts ofta kemiska konserveringsmedel till bearbetade livsmedel för att förhindra mikrobiella faror, men överanvändning eller missbruk av dessa konserveringsmedel kan introducera nya kemiska risker. Därför är säkerheten för bearbetade livsmedel nära kopplad till de metoder som används i deras bearbetning, där den valda bearbetningstekniken spelar en avgörande roll för att bestämma livsmedlets övergripande säkerhet.